Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms