Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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