Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1nQ497L1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1nQ497L1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms