Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt35Q497I4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms