Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc110Q3V125 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms