Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc185Q3V118 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms