Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn34b4Q3V0X2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn34b4Q3V0X2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn34b4Q3V0X2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn34b4Q3V0X2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn34b4Q3V0X2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn34b4Q3V0X2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn34b4Q3V0X2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Cldn34b4Q3V0X2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cldn34b4Q3V0X2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms