Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Dnah12Q3V0Q1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnah12Q3V0Q1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnah12Q3V0Q1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms