Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbm44Q3V089 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm44Q3V089 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms