Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnaaf3Q3UYV8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms