Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Mbd3l2Q3UXB0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Mbd3l2Q3UXB0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms