Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clpsl2Q3UW21 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms