Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nr1d1Q3UV55 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms