Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Syndig1lQ3USQ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms