Protein–RNA interactions for Protein: Q3URF8

Kctd21, BTB/POZ domain-containing protein KCTD21, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd21Q3URF8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kctd21Q3URF8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kctd21Q3URF8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms