Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsponQ3UPR9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SbsponQ3UPR9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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