Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Shisa3Q3UPR0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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