Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sec31aQ3UPL0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sec31aQ3UPL0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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