Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q3UPC7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q3UPC7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms