Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nlrc4Q3UP24 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nlrc4Q3UP24 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms