Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cobll1Q3UMF0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms