Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cog7Q3UM29 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms