Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Parp3Q3ULW8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Parp3Q3ULW8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms