Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctsll3Q3ULP7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctsll3Q3ULP7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms