Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CrxosQ3UL53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CrxosQ3UL53 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms