Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ell2Q3UKU1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms