Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edc4Q3UJB9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edc4Q3UJB9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms