Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf10Q3UIW5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf10Q3UIW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms