Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmed8Q3UHI4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmed8Q3UHI4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms