Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx27Q3UHD6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx27Q3UHD6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms