Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tnrc6cQ3UHC0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms