Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Yipf3Q3UDR8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms