Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cops9Q3U898 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cops9Q3U898 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms