Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ssbp4Q3U4B1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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