Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Hvcn1Q3U2S8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Hvcn1Q3U2S8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hvcn1Q3U2S8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms