Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Kdm4dQ3U2K5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms