Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms