Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX3

Smyd5, SET and MYND domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd5Q3TYX3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smyd5Q3TYX3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smyd5Q3TYX3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms