Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mbd6Q3TY92 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mbd6Q3TY92 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms