Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Calr4Q3TQS0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Calr4Q3TQS0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms