Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gtf3c3Q3TMP1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms