Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp39Q3TIX9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp39Q3TIX9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms