Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zfp444Q3TDV8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms