Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem104Q3TB48 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms