Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hddc2Q3SXD3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hddc2Q3SXD3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms