Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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H2-M3Q31093 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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H2-M3Q31093 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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H2-M3Q31093 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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H2-M3Q31093 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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H2-M3Q31093 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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H2-M3Q31093 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2-M3Q31093 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms