Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna5Q2MKA5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms