Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cers3Q1A3B0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cers3Q1A3B0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms