Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpusd3Q14AI6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpusd3Q14AI6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms