Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpusd2Q149F1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rpusd2Q149F1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rpusd2Q149F1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rpusd2Q149F1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rpusd2Q149F1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rpusd2Q149F1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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